De inkomsten van de Stichting Vrienden van het St Jansdal zijn voornamelijk afkomstig uit particuliere en bedrijfsgiften en van onze donateurs. Daarnaast kunnen voor specifieke projecten bijdragen gevraagd worden aan particuliere en nationale fondsen. Ook worden evenementen georganiseerd, zoals het Open Huis St Jansdal of het galadiner waar dokters koken voor het goede doel. Derden komen soms ook in actie voor de Vrienden van het St Jansdal en organiseren activiteiten voor het goede doel. De Stichting Vrienden van het St Jansdal verkoopt ook eigen artikelen zoals de ansichtkaarten van Henk Bakker en het boek "Op Handen". Beide zijn verkrijgbaar in het winkeltje op de begane grond in Harderwijk. 

De inkomsten en uitgaven van de Stichting Vrienden van het St Jansdal worden cijfermatig in de jaarrekening weergegeven. In de jaarrekening wordt een verantwoording per activiteit en/of project gegeven.